AlphaFold3 научили моделировать подвижные части белков

Международная группа биологов разработала метод, позволяющий нейросети AlphaFold3 точнее определять форму изменчивых участков белковых молекул. Это открывает путь к пониманию их роли в работе ферментов и других белков. Результаты опубликованы в пресс-службе Института науки и технологий Австрии. Об этом рассказывает издание Pro город будущего.

Традиционные методы, такие как рентгеновская кристаллография, дают усредненные изображения, на которых гибкие участки молекул не видны. Ранее считалось, что они играют незначительную роль, но сейчас ученые активно изучают их влияние на функции белков.

Новая версия AlphaFold3 анализирует не только аминокислотную последовательность, но и данные криоэлектронной микроскопии и спектроскопии ядерного магнитного резонанса. Это позволяет нейросети точнее определять расположение атомов в подвижных частях молекул.

Проверки показали, что обновленная система на 77% точнее моделирует сложные структуры по сравнению с предыдущими версиями. Благодаря этому ученые смогли раскрыть структуру белка бета-2-микроглобулина и других слабо изученных молекул, выявив ранее неизвестные вариации. Исследователи надеются, что новый подход позволит ответить на вопросы, недоступные традиционной кристаллографии.